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Wissenschaftliche Suchmaschinen
Wissenschaftliche Nachrichten
- PLoS Journals: Kostenlose wissenschaftliche Journale über Biologie, Medizin und Bioinformatik. Die Public Library of Science hat als nonprofit Organisation eine Gegenbewegung zu den immer teurer werdenden Zeitschriften à la Nature gestartet und ist recht erfolgreich. (engl.)
Forschungseinrichtungen
- ExPASy Proteomics Server: Einstiegspunkt zu den wichtigen Protein-Datenbanken Swiss-Prot und TrEMBL. Außerdem gibt es Links zu den wichtigsten Werkzeugen zur Proteinstrukturanalyse. Primär-, Sekundär- und Tertiärstrukturen können, z.B. von SWISS-MODEL, simuliert, Ähnlichkeitssuchen druchgeführt und 3D-Bilder betrachtet werden. (engl.)
- National Center of Biotechnology Information: Dieses Portal des amerikanischen National Institute of Health bietet die wichtigsten Datenbanken zum Durchsuchen an. Außerdem kann man hier komfortabel BLAST-Suchen mit Nukleotiden oder Aminosäuresequenzen durchführen und nach wissenschaftlichen Arbeiten zu speziellen Themen, z.B. in PubMed, suchen. (engl.)
Wissenschaftliche Computerprogramme
- ClustalW: Das Europäische Bioinformatik Institut bietet mit ClustalW die Möglichkeit an, online Stammbäume aus DNA- oder Aminosäuresequenzen erstellen zu lassen. Es vereint damit mehr oder weniger die Funktionen der "Offline-Programme" ClustalX und TreeView. Eine kurze, bebilderte Anleitung ist auch hier zu finden. (engl.)
- T-Coffee: Erweiterung zu ClustalW, die eine nettere, farbige Darstellung von DNA-/Protein-Vergleichen erlaubt. (engl.)
- DeepView: Dieses Programm dient dazu offline PDB-Dateien, also 3D-Modelle von Proteinen, zu betrachten und manipulieren. (engl.)
- Protein Explorer: Dieses Plug-In für Browser (z.B. den Internet Explorer) ermöglicht das Betrachten und drehen von Proteinen. Nebenbei erhält man zusätzliche Information zu dem betrachteten Protein aus der Datenbank. (engl.)
